南京梅山医院为国务院国资委下属中国宝武集团和南京市国资委下属新工集团联合举办的医院，1970年正式组建，1993年经上海市卫生局评审为二级甲等医院，原名为上海梅山医院，2017年5月更名为南京梅山医院。现为江苏省人民医院医联体医院，皖南医学院、蚌埠医学院和南京医科大学的教学医院。
截止2023年1月底，共有职工 766 人，卫生技术人员 654人，占85.4 %。全院职工博士生 1人，研究生 38人，本科 512人。高级职称77人，中级 328人，学科带头人21人。
南京梅山医院临床医技科室设置齐全，总院有27个科室：感染科，神经内科，内分泌科，心血管内科，呼吸内科，ICU（重症医学科），儿科，妇产科，骨科，泌尿外科，脑外科，胸外科，普外科，消化内科，肾内科，口腔科，眼科，五官科，手术麻醉科，皮肤科、急诊科、体检中心、药剂科、功能科，检验科，放射科，病理科。分院有5个科室：康复医学科，普内科，肿瘤内科，精神科，职业病科。
南京梅山医院目前已拥有10个市级重点专科：神经内科、麻醉科、重症医学科、心内科、放射科、呼吸内科、肾脏内科、骨科、精神科和内分泌。
医院拥有128排CT和1.5T核磁大型设备各1台、高端DR2台、高端B超3台，引进KL型二氧化碳激光治疗机，硬件能力不断改善。实施医疗用房出新改造，病人就诊环境提档升级，医疗床位增加近两个病区。建有血液净化、高压氧舱、体外碎石、DSA、肿瘤热疗、健康体检等医疗服务中心。