布羅德研究所高級研究科學(xué)家Brenton R Paolella補充說,“終末,我們了解了細胞生物學(xué)的一些基本基礎(chǔ)。不過,我們也發(fā)現(xiàn)了開發(fā)治療方法的機會。而這是一個很好的例子,說明你可以用癌癥依賴性圖譜做什么?!?/span>
磷酸鹽泛濫
磷酸鹽是生命所必需的,存在于骨骼和牙齒的礦物中,也存在于DNA的骨架中。盡管之前的研究已顯示卵巢癌細胞中的磷酸鹽輸入蛋白SLC34A2水平異常高,但是該蛋白存在于其他組織中,如肺部和腸道,因此用藥物靶向它可能會導(dǎo)致副作用。
在高表達SLC34A2的癌細胞系中選擇性觀察到XPR1依賴性。圖片來自Nature Cancer, 2022, doi:10.1038/s43018-022-00360-7。
為了給未來的治療方法找到更好的靶標(biāo),這些作者專注于尋找子宮癌細胞和卵巢癌細胞特有的弱點。他們進行了針對DepMap 的CRISPR篩選,旨在探究讓癌細胞中關(guān)鍵基因失活的效果。在這851種細胞系中,他們觀察到當(dāng)XPR1(編碼少有已知從細胞中輸出磷酸鹽的蛋白)被關(guān)閉時,子宮癌細胞和卵巢癌細胞比其他細胞更容易死亡。特別是,XPR1失活的癌細胞只有在輸入大量磷酸鹽時才會死亡。此外,在這些癌細胞中,經(jīng)常發(fā)現(xiàn)的另一個分子特征是存在高水平的SLC34A2蛋白。
接下來,Golub團隊在存檔的患者數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)了磷酸鹽輸入蛋白和磷酸鹽輸出蛋白之間的一些相關(guān)性的證據(jù)。Bondeson和Paolella說,這種相關(guān)性提出了一個明確的假設(shè):磷酸鹽的堆積本身是有毒的。
邁向治療
回到實驗室后,該團隊測試了他們的理論。在卵巢和子宮癌細胞模型中,他們發(fā)現(xiàn),當(dāng)癌細胞高表達磷酸鹽輸入蛋白XPR1時,它們依靠這種蛋白生存。而當(dāng)他們讓XPR1失活或用一種蛋白抑制它時,癌細胞積累了磷酸鹽,生長得更慢,并死亡。
這些作者說,這種他們用來抑制XPR1的蛋白經(jīng)過進一步開發(fā)后可能成為這些癌癥的潛在治療方法,Golub實驗室將繼續(xù)研究這種蛋白是否是一種可行的治療策略。
Bondeson說,“卵巢癌的一些基因依賴性很難用藥物來靶向,但是我們發(fā)現(xiàn)我們實際上可以用一種蛋白來靶向XPR1并殺死癌細胞。這真地很令人興奮。”
這些作者還觀察到XPR1依賴性與另一個叫做KIDINS220的基因的依賴性密切相關(guān),KIDINS220參與神經(jīng)發(fā)育,但以前沒有與磷酸鹽運輸聯(lián)系起來。他們認為,XPR1和KIDINS220共同形成了一個參與將磷酸鹽運出細胞的蛋白復(fù)合物。這種聯(lián)系提供了大量的其他科學(xué)問題:KIDINS220是否也能成為新藥物的靶標(biāo)?與KIDINS220有關(guān)的疾病是否涉及磷酸鹽調(diào)節(jié)問題?
Bondeson和Paolella說,KIDINS220參與磷酸鹽運輸表明,關(guān)于XPR1和KIDINS220如何相互作用以及如何與磷酸鹽相互作用,還有很多東西需要學(xué)習(xí),更根本的是,在科學(xué)上對細胞如何感知、調(diào)節(jié)和儲存磷酸鹽的理解仍然存在很大的差距。他們補充說,磷酸鹽堆積究竟是如何殺死細胞的,還需要加以澄清。例如,他們注意到在裝載磷酸鹽的細胞的顯微鏡圖片中出現(xiàn)了不尋常的膜包圍的囊狀物。他們不知道這些囊狀物或者說空泡是否儲存了額外的磷酸鹽,或者是即將到來的死亡的標(biāo)志。
Paolella說,“我們?nèi)匀粚@些結(jié)果感到非常困惑,但是以一種令人興奮的方式。我們的研究工作表明,關(guān)于磷酸鹽平衡的一些非?;镜膯栴}仍然是未知的?!?/span>